Twój świat ... Twoje zasady! W związku z tym jesteś agentem i specjalistą od reżimu, wspieranego przez najwyższą tajną agencję rządową USA, która obaliła skorumpowanego rządu San Esperito. Rogee South American State podejrzewa się, że zbierają broń masowego rażenia i Twoim misją jest negowanie zagrożenia, jakie stanowi pokój światowy. Można być na twoją korzyść, że tropikalny raj zamierza wprowadzić się jako różne frakcje rywalizujące o władzę - potrzebuje po prostu delikatnego szturchania we właściwym kierunku.
Just Cause oferuje swobodę zadań, jak chcesz: grać w frakcje wyspy przeciwko sobie, wpadając na bunt wśród mas i budowa