Efter begivenhederne i den banebrydende originale Crysis er udlændinge vendt tilbage til en verden, der er hærget af klimakatastrofer. Da de indtrængende spilder affald til New York og begynder et angreb, der truer den samlede udslettelse af menneskeheden, er det kun du har teknologien til at lede fightback. Når du spiller som en super-soldat udstyret med den opgraderede Nanosuit 2.0, skal du tilpasse dig slagmarken ved hjælp af dets spil, der skifter stealth, rustning og magtevner. Tilpas din nanosuit og våben i realtid og lås utrolige nye kræfter op, når du kæmper for menneskehedens overlevelse.