Tom Clancy’nin PC Bölümü 2, ismin ilk oyununu takip ediyor. İlk oyun, bir çevre teröristi tarafından New York'ta piyasaya sürülen dünya çapında silahlı çiçek hastalığının (Yeşil Zehir olarak bilinir) bir salgının sonrasında ele alındı. Pandemi harap olmuş toplumdan önceki son günlerde, ABD hükümeti Stratejik Anayasa Bölümü veya SHD olarak bilinen bir yerli uyuyan ajansı olan bölümü aktive etti. Hastalığın kaynağını bulmak ve hukuk ve düzeni korumak ve geri yüklemek bölümün göreviydi.
Devam filmi yedi ay sonra masal alır ve eylem Washington'a taşındı. Washington tüm hükümet yetkililerinden tahliye edildi ve Hava Kuvvet