Subaeria è un intenso rompicapo d'azione con elementi roguelike. I giocatori usano il loro ingegno per manipolare i propri nemici affinché si distruggano a vicenda. Dovranno essere intelligenti nel modo in cui affrontano le diverse situazioni e pensare in modo strategico a come utilizzare l'ambiente e le abilità per sconfiggere i loro nemici.